アニメ『わがまま☆フェアリー ミルモでポン!』の終了から30年後の世界、人間界の主人公である南楓と結木摂は結婚して結木姓となり、2人の兄妹を持ち、妖精界の主人公であるミルモとリルムは結婚してメルモとモルモという2人の王子・王女を持つ。なお、マルモ国王は病死しているため、ミルモが国王で、リルムが王妃。原作やアニメに出ていない悪しき妖精がダアク様を復活させた。プレーヤーは結木家の2人の子供のうちの何れか。