ネルは、ごく普通の小学生として日々を過ごしている。 学校ではカレーとゲームをこよなく愛し、通知表も「まあまあ」という、どこにでもいるような女の子だ。 しかし、放課後になると彼女の真の顔が明らかになる。 彼女は「暗殺小学生」として、裏社会の任務を遂行するプロフェッショナルなのだ。その任務内容は多岐にわたり、時には危険な状況にも身を置く。表の顔と裏の顔を使い分け、誰にもその正体を知られることなく活動してきた。