かつて戦国の世にその名を刻んだ、影の存在――忍。 時代は移ろい、刀は消え、戦は歴史となった。 だが、その技と血は、いまなお密かに受け継がれている。 現代。 都立才賀高等学校には、珍しく不思議な一つの部活が存在する――その名も「シノビ部」。 そこに所属するのは、学生であると同時に、忍として生きる三人の少女。 百地彩音――三年生にして部長 猿飛雛乃――二年生 風魔伊織――二年生 しかし、そんなシノビ部の実態は学校や街の何でも屋さん。おまけに部員も少なく依頼も来ない廃部寸前！？