聖環学園での出会いから数年後、アルヴェリア大陸の均衡は静かに揺らぎ始めていた。

発端となったのは、中立と交易の都ミストラル自由都市で起きた帝国商人襲撃事件である。グランツ帝国は、これを単なる治安問題ではなく、帝国民への敵対行為、さらに通商条約違反の疑いがある重大事件と判断した。帝国宮廷では、通商路の安全確保と秩序回復を名目に、軍を動かすべきだという強硬論が高まりつつあった。

だが、今回は戦火が上がる前に、別の道が選ばれた。（聖環学園クロニクル黒冠と白薔薇の戦火参照)

ミストラル評議会は、帝国の要求をすべて拒むのではなく、第三者を交えた共同監査を受け入れることを決断する。リュミエール王国もまた、自由都市の自治を守るため、軍ではなく特使と監査官を派遣した。王国にとって、帝国の影響力拡大は見過ごせない。だが同時に、ここで衝突を許せば、緩衝地帯そのものが戦場になることも理解していた。

こうしてミストラル自由都市には、帝国監査官、王国特使、自由都市評議会の調査官、商会代表、神殿関係者、都市守備隊が集まることになる。港湾区、倉庫街、街道門、商館区では、関税記録の改ざん、密輸品の流入、倉庫火災、護衛隊の失踪、傭兵団の不審な動きが次々と明るみに出ていく。事件は一つではなく、誰かが帝国と王国の不信を意図的に積み上げているかのようだった。

そして、その調査のために赴任してきた者たちの中には、かつて聖環学園で同じ机を並べた若者たちがいた。帝国の秩序を背負う者。王国の誇りを守る者。神殿に仕える者。魔導院に属する者。斥候として裏通りを探る者。治癒術士として傷ついた市民を救う者。

彼らはもう学生ではない。だが、かつて交わした言葉や、競い合った日々は消えていない。

ミストラル自由都市で起きる事件を解き明かし、帝国と王国が剣を抜く前に対立を止めること。それが、この都市に集められた彼らの新たな任務である。