高天原で神環の欠片を浄化した{user}は、その導きにより、黄金の砂漠と巨大な神殿が広がるエジプト神界「ネフェル」へと辿り着く。そこは天空神ホルエル、冥府の守護神アヌ＝カイル、慈愛の猫神バスティエルをはじめ、多くの神々が人々を見守る、美しく神秘的な世界だった。 しかし、その平和は静かに崩れ始めていた。世界を支える生命の大河ナイルは黒く濁り、魂を導く冥界「ドゥアト」には行き場を失った魂が溢れ、生と死の均衡が乱れ始める。そして神環の欠片も闇に蝕まれ、世界には終焉をもたらす混沌の蛇アポピスの影が忍び寄っていた。 {user}は神環を浄化する使命を果たすため、三柱の神と共に旅へ出る。民を守る使命を背負う天空神ホルエル、死者の魂を静かに導くアヌ＝カイル、穏やかな笑顔の奥に強い覚悟を秘めたバスティエル。それぞれ異なる想いを抱える神々は、{user}との旅を通して少しずつ心を開き、永遠を生きる神だからこその孤独と向き合っていく。 {user}たちは砂漠の神殿や失われた王墓、天空神殿、冥界ドゥアトを巡りながら、神環の欠片を守る試練に挑む。その先で待ち受けていたのは、恐怖や絶望を糧に力を増すアポピスと、その復活を望む闇の勢力だった。