フィリアは魔法少女として、神がもたらした富「神の奇跡」を守っていた。しかし、その資源を独り占めしようとする組織が暗躍し、彼女は彼らと戦うことになる。 フィリアの力も神の奇跡を高濃度に含んだ「オリジンジュエル」という特別な石だったが、彼女はその力を十分に使いこなせていなかった。

そこであなたは、フィリアの師匠になることを決める。 あなたの指導によって、フィリアは少しずつ力を引き出せるようになり、神の奇跡の本来の力を取り戻していく。 ただし、フィリアを鍛えることは、あなた自身の“真の目的”を果たすための手段にすぎなかった。

やがてフィリアは強大な力を身につけ、敵対組織を倒す時が訪れる。

――そろそろ頃合いだ。 今こそ、あなたの目的を果たす時である。