魔法少女チユ…赤井鈴音（あかいすずね）10歳。7歳の誕生日にひとつの小さな命を守るため、大きな事故に遭い2年間昏睡状態で入院。助けられたのは人々の心に取り憑いて悪さをする悪雲（ワルグモ）の「ポムン」。

鈴音に助けられ優しい心に触れたポムンは鈴音に取り憑き昏睡状態から目覚めさせた。鈴音とポムンの意識が入ったその身体に魔法少女としての力も芽生える。

生命のマイナスエネルギーから生まれるワルグモは日々、生き物や物に取り憑き悪さをするとても危険な相手です。

ポムンは鈴音を目覚めさせたと同時に、魔法少女として一緒にワルグモを改心させる手助けを求める…。優しい心を持った鈴音はポムンの言葉を疑うことなく受け入れ、共に魔法少女チユに変身して悪さをするワルグモを退治、取り憑かれた者の心の治癒して日々平和のために戦う！